Dokument: Systematische Analyse der Genexpression eines seltenen ekkrinen Schweißdrüsenkarzinoms ( Ekkrines Porokarzinom)
| Titel: | Systematische Analyse der Genexpression eines seltenen ekkrinen Schweißdrüsenkarzinoms ( Ekkrines Porokarzinom) | |||||||
| URL für Lesezeichen: | https://docserv.uni-duesseldorf.de/servlets/DocumentServlet?id=66951 | |||||||
| URN (NBN): | urn:nbn:de:hbz:061-20241008-113708-2 | |||||||
| Kollektion: | Dissertationen | |||||||
| Sprache: | Deutsch | |||||||
| Dokumententyp: | Wissenschaftliche Abschlussarbeiten » Dissertation | |||||||
| Medientyp: | Text | |||||||
| Autor: | Holst, Svenja [Autor] | |||||||
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| Beitragende: | Prof. Dr. med. Redler, Silke [Gutachter] Prof. Dr. Adjaye, James [Gutachter] | |||||||
| Dewey Dezimal-Klassifikation: | 600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften » 610 Medizin und Gesundheit | |||||||
| Beschreibungen: | Schweißdrüsenkarzinome sind selten, wobei die häufigste Form das ekkrine Porokarzinom (EP) ist. Sein gutartiges Äquivalent ist das ekkrine Porom (EPO), welches ein mögliches Übergangs- stadium in der EP-Entwicklung darstellt. Frühere Forschungsarbeiten haben erste Einblicke in das Genom des EP gegeben. Jedoch haben nur wenige Studien eine molekulare Charakterisie- rung anhand von Genexpressionsanalysen durchgeführt. Das fehlende Wissen über Genexpres- sionsprofile schränkt das Verständnis der EP-Biologie und möglicher Angriffspunkte für Prä- zisionstherapien ein. Ziel dieser Studie war es daher, durch Untersuchung der tumorspezifi- schen Genexpression tiefere Einblicke in die Biologie des EP zu gewinnen und potentielle Schlüsselfaktoren aufzudecken, die den malignen Übergang vom EPO zum EP vorantreiben. Eine Genexpressionsanalyse erfolgte an 23 formalinfixierten, in Paraffin eingebetteten Proben primärer EP und umgebender normaler Haut (NH). Die genomweite Transkriptomanalyse mit- tels Microarray wurde in einer Sondierungskohorte von 10 EP durchgeführt. Die Ergebnisse wurden mittels quantitativer Polymerase-Kettenreaktion (qPCR) in einer unabhängigen Ko- horte von 13 EP validiert und die Ergebnisse aus den EP-Proben in 17 EPO getestet.
Die Transkriptomanalyse demonstrierte deutliche Unterschiede der Genexpression bei den 10 untersuchten EP. Durch hierarchisches Clustern wurden zwei EP-Tumorsubtypen mit deutli- chen transkriptionellen Unterschieden identifiziert, was auf eine Tumorheterogenität hindeutet. Zudem wurde bei EP im Vergleich zu NH eine weit verbreitete Herunterregulierung von Genen beobachtet. Zu den herunterregulierten Genen gehörten Cluster of Differentiation 74 (CD74), N-myc-downstream-regulated-gene-1 (NDGR1), Serin/Arginin Repetitive Matrix 2 (SRRM2), Cell Division Control Protein 42 (CDC42), Annexin A2 (ANXA2), Kruppel-like Factor 9 (KFL9) und Ribosome Biogenesis Factor 53 (NOP53). CD74, NDGR1, SRRM2, ANXA2 und NOP53 wiesen eine kontinuierliche Verringerung der Expression von NH über EPO zu EP auf. Dies bekräftigt die Annahme, dass EPO als Übergangszustand in der EP-Entwicklung fungiert. Die Ergebnisse legen zudem nahe, dass neben dem p53-Signalweg und dem Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR)-Weg weitere Mechanismen der Tumorgenese, wie die Beteiligung der Vascular Endothelial Growth Factor A/-Receptor 2 (VEGFA/VEGFR2)-Achse und des En- dothelin-Weges, relevant sein könnten und potentielle Ansätze für Therapien bieten. Umfang- reichere Studien mit einer größeren Probenanzahl sind nötig, um die Ergebnisse zu validieren und ein tieferes Verständnis der EP-Biologie zu erlangen.Sweat gland carcinomas are uncommon, with eccrine porocarcinoma (EP) being the most prev- alent type. Its benign counterpart is the eccrine poroma (EPO), which represents a potential transitional state in EP development. Previous research has provided first in-depth insights into the genome of EP. However, only a few studies have performed molecular characterizations based on gene expression analysis. The lack of knowledge about gene expression profiles limits the understanding of EP biology, and possible targets for precision therapies. The aim of this study was therefore to gain further insights into the biology of EP by investigating tumour- specific gene expression and to uncover potential key factors that drive the malignant transition from EPO to EP. A gene expression analysis of 23 formalin-fixed, paraffin-embedded samples of primary EP and surrounding normal skin (NH) was performed. Genome-wide transcriptome analysis by microarray was conducted in an exploratory cohort of 10 EP. The results were validated by quantitative polymerase chain reaction (qPCR) in an independent cohort of 13 EPs and the results from the EP samples were tested in 17 EPO. Transcriptome analysis demonstrated clear differences in gene expression in the 10 EPs ana- lysed. Hierarchical clustering identified two EP tumour subtypes with distinct transcriptional differences, indicating tumour heterogeneity. In addition, widespread downregulation of genes was observed in EP compared to NH. Downregulated genes included Cluster of Differentiation 74 (CD74), N-myc-downstream-regulated-gene-1 (NDGR1), Serine/Arginine Repetitive Matrix 2 (SRRM2), Cell Division Control Protein 42 (CDC42), Annexin A2 (ANXA2), Kruppel-like Factor 9 (KFL9) and Ribosome Biogenesis Factor 53 (NOP53). CD74, NDGR1, SRRM2, ANXA2 and NOP53 showed a continuous decrease in expression from NH to EPO to EP. This provides additional evidence for the notion that EPO serves as an intermediate stage in the development of EP. The results also suggest, that in addition to the p53 signaling pathway and the Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) pathway, other mechanisms of tumour development, such as the involvement of the Vascular Endothelial Growth Factor A/- Receptor 2 (VEGFA/VEGFR2) axis and the endothelin pathway, may be relevant and offer potential approaches for therapies. More extensive studies with a larger number of samples are necessary to validate the findings and gain a deeper understanding of EP biology. | |||||||
| Lizenz: |  Dieses Werk ist lizenziert unter einer Creative Commons Namensnennung 4.0 International Lizenz | |||||||
| Fachbereich / Einrichtung: | Medizinische Fakultät » Institute » Institut für Humangenetik und Anthropologie | |||||||
| Dokument erstellt am: | 08.10.2024 | |||||||
| Dateien geändert am: | 08.10.2024 | |||||||
| Promotionsantrag am: | 22.05.2024 | |||||||
| Datum der Promotion: | 01.10.2024 |
