Dokument: Einfluss auf den Arbeitsworkflow bei der mikrobiologischen Urindiagnostik und Sensitivität der Detektion von anspruchsvollen Uropathogenen durch Einführung einer Laborautomatisierung

Titel:	Einfluss auf den Arbeitsworkflow bei der mikrobiologischen Urindiagnostik und Sensitivität der Detektion von anspruchsvollen Uropathogenen durch Einführung einer Laborautomatisierung
Weiterer Titel:	Influence on the workflow in microbiological urine diagnostics and sensitivity of the detection of fastidious uropathogens through the introduction of laboratory automation
URL für Lesezeichen:	https://docserv.uni-duesseldorf.de/servlets/DocumentServlet?id=63254
URN (NBN):	urn:nbn:de:hbz:061-20230801-101918-2
Kollektion:	Dissertationen
Sprache:	Deutsch
Dokumententyp:	Wissenschaftliche Abschlussarbeiten » Dissertation
Medientyp:	Text
Autor:	Frömgen, Anna Christina [Autor]
Dateien:	[Dateien anzeigen] Adobe PDF [Details] 1,42 MB in einer Datei [ZIP-Datei erzeugen] Dateien vom 25.07.2023 / geändert 25.07.2023
Beitragende:	Prof. Dr. med. MacKenzie, Colin R. [Gutachter] PD Dr. med. Schiffner, Erik [Gutachter]
Dewey Dezimal-Klassifikation:	600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften » 610 Medizin und Gesundheit
Beschreibungen:	Urinproben haben einen großen Anteil an der diagnostischen Arbeitsbelastung und die Richtlinien für die Inkubation der Proben für bis zu 48 Stunden behindern den Arbeitsfluss, speziell in Fällen automatisierter Systeme, da die Bilderstellung der Agarplatten zeitaufwändig ist. Die Detektion anspruchsvoller Uropathogene wie Actinotignum schaalii, Aerococcus spp., und Corynebacterium urealyticum erfordert längere Bebrütungszeiten, welche einen Rückstau in automatisierten Systemen verursachen können. Andererseits ermöglichen bildgebende Systeme den effizienten Gebrauch von standardisierten Bebrütungszeiten, daher ist es wichtig die optimale Inkubationszeit für diese Uropathogene zu ermitteln. Alle Urinproben über einen Zeitraum von 14 Wochen wurden nach einem modifizierten diagnostischen Flowchart ausgewertet. Die Proben wurden mittels eines automatisierten Systems (WASPLab™) auf Columbia-CNA und CHROMagar Orientation Platten aufgetragen und nach 0, 18, 24 und 48 Stunden ausgewertet. Die Inkubation erfolgte bei 36°C und Umgebungsatmosphäre. Die Ergebnisse wurden in Hinblick auf die minimale Inkubationszeit untersucht, welche für die Detektion von anspruchsvollen und seltenen Uropathogenen notwendig ist. Die Leukozytenbestimmung erfolgte mittels Leukozyten-Esterase Teststreifen und wurde semiquantitativ als negativ, +, ++, und +++ erfasst, wobei in Fällen eines technischen Fehlers, der die Auswertung verhinderte, die Leukozyten als +++ gewertet wurden. Es wurden 4993 Proben analysiert. 52 (1%) anspruchsvolle Uropathogene wurden nachgewiesen: Aerococcus urinae, 39; Aerococcus sanguinicola, 2; Actinotignum schaalii, 11. Corynebacterium urealyticum wurde nicht nachgewiesen. Alle A. urinae und A. sanguinicola wurden spätestens nach 24h detektiert, 38 nach 18h und weitere 3 nach 24h. 2 A. schaalii wurden nach 18h, 3 nach 24h und 6 nach 48h entdeckt. Basierend auf diesen Ergebnissen wurde ein diagnostischer Flowchart generiert, nach dessen Algorithmus nur 16% der Proben eine Inkubation von 48 Stunden erfordern. Das Resultat entspricht einer Reduktion des Inkubationsplatzes im Brutschrank um 54%, und somit einer erheblichen Einsparung der Bilderstellungszeit, sowie einer deutlich effizienteren Ausnutzung des automatisierten Systems. Urine samples make up a large portion of the diagnostic work-load and guidelines for the incubation of samples for up to 48 h can hinder the work-flow, especially true for automated systems as imaging plates is time-consuming. Detection of fastidious uropathogens such as Actinotignum schaalii, Aerococcus spp. and Corynebacterium urealyticum require extended incubation times, which can cause a backlog in an automated system. On the other hand, imaging systems may enable an efficient use of standardised incubation times and thus it is important to determine the optimal incubation time for these uropathogens. All urine specimens received over time period of 14 weeks were analysed according to a modified diagnostic flow-chart. Specimens were plated onto Columbia-CNA, and CHROMagar Orientation plates using an automated system (WASPLab™) and then imaged at time points 0h, 18h, 24h and 48h. The plates were incubated at 36°C and normal atmosphere. The results were then analysed to detect the minimal incubation time that would allow the detection of fastidious and infrequent uropathogens. The leucocyte count was determined using leucocyte esterase strips and documented semi-quantitatively as negative, +, ++ and +++ or if a technical error prevented a correct interpretation the specimen was assumed to have +++ leucocytes. We analysed 4993 samples. Fifty-two (1 %) fastidious uropathogens were detected: Aerococcus urinae, 39; Aerococcus sanguinicola, 2; Actinotignum schaalii, 11. Corynebacterium urealyticum was not detected. All A. urinae and A. sanguinicola were detected by 24 h; 38 at 18 h and a further 3 at 24 h. Two A. schaalii were detected at 18h, three at 24 h and six at 48 h. Based on these results we generated a diagnostic flow-chart and using this algorithm only 16 % of the samples require incubation for 48h. This represents a saving of 54 % of the incubation time of plates, a considerable saving of imaging time allowing a more efficient use of the automated system.
Lizenz:	Dieses Werk ist lizenziert unter einer Creative Commons Namensnennung 4.0 International Lizenz
Fachbereich / Einrichtung:	Medizinische Fakultät » Institute » Institut für Medizinische Mikrobiologie
Dokument erstellt am:	01.08.2023
Dateien geändert am:	01.08.2023
Promotionsantrag am:	12.05.2023
Datum der Promotion:	20.07.2023