Dokument: Analyse des oralen Mikrobioms stammzelltransplantierter Patienten im Verlauf
| Titel: | Analyse des oralen Mikrobioms stammzelltransplantierter Patienten im Verlauf | |||||||
| Weiterer Titel: | Kinetic analysis of the oral microbiome of stem cell transplant patients | |||||||
| URL für Lesezeichen: | https://docserv.uni-duesseldorf.de/servlets/DocumentServlet?id=51653 | |||||||
| URN (NBN): | urn:nbn:de:hbz:061-20191202-104559-1 | |||||||
| Kollektion: | Dissertationen | |||||||
| Sprache: | Deutsch | |||||||
| Dokumententyp: | Wissenschaftliche Abschlussarbeiten » Dissertation | |||||||
| Medientyp: | Text | |||||||
| Autor: | Albrecht, Christin [Autor] | |||||||
| Dateien: |
| |||||||
| Beitragende: | Prof. Dr. Borkhardt, Arndt [Betreuer/Doktorvater] PD Dr. Kobbe, Guido [Gutachter] | |||||||
| Stichwörter: | Orales Mikrobiom, Stammzelltransplantation | |||||||
| Dewey Dezimal-Klassifikation: | 600 Technik, Medizin, angewandte Wissenschaften » 610 Medizin und Gesundheit | |||||||
| Beschreibungen: | Der menschliche Organismus benötigt die mikrobielle Kolonisation für lebenswichtige physiologische Prozesse, wie Bildung und Funktion des Immunsystems. Änderungen innerhalb dieser Symbiose sind als Pathogenitätsfaktor komplexer Autoimmunreaktionen beschrieben und haben in diesem Zusammenhang Bedeutung für die allogene hämatopoetische Stammzelltransplantation (alloHSZT).
Ziel dieser Arbeit war die Etablierung eines molekulargenetischen Verfahrens unter Nutzung von zwei Sequenziermethoden zur Charakterisierung des oralen Mikrobioms von Patienten mit malignen hämatoonkologischen Grunderkrankungen. Dafür wurde Material des lateralen Zungenrandes von zwei Patienten im Langzeitverlauf sowie das der entsprechenden Spender vor dem Hintergrund erhobener Metadaten analysiert. Dabei entsprachen die im Spendermikrobiom nachgewiesenen Gattungen der physiologischen Komposition des oralen Mikrobioms der Zunge gesunder Probanden. Die Ergebnisse der Verlaufsuntersuchungen der beiden stammzelltransplantierten Patienten zeigten eine Regeneration des zuvor im Rahmen der Chemotherapie und Konditionierung reduzierten Mikrobioms. So erhöhte sich die initial zum Zeitpunkt vor alloHSZT bei beiden Patienten nachgewiesene geringe Anzahl an Gattungen 90 bzw. 120 Tage nach Transplantation auf maximale Werte. Hinsichtlich des Vergleichs beider Sequenziermethoden zeigten sich im Wesentlichen Gemeinsamkeiten aber auch Unterschiede in den Ergebnissen zu Vorkommen und Häufigkeit einzelner Gattungen. Gegenwärtig werden diese Daten anhand größerer Patientenkohorten und mittels spezifischer bioinformatischer Diversitäts- und cluster-Analysen validiert, die differenziertere Aussagen zu Muster und Kinetik des oralen Mikrobioms unter alloHSZT und Rückschlüsse bezüglich typischer Komplikationen wie Sepsis, graft versus host disease, Mukositis und Abstoßung erlauben werden. Solche Untersuchungen sind notwendig, um die Relevanz der mikrobiellen Komposition als prognostischer und diagnostischer Marker genauer zu evaluieren.For performing of life-essential physiological processes the human organism requires microbiological colonization – such as build up and functioning of the immune system. Any changes in this symbiosis are well known as pathogenic factors for complex immune reactions and have in this context crucial effects on the allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (alloHSCT). The main goal of this dissertation has been to establish a molecular genetic procedure for a microbiome characterization of patients suffering from malignant hematopoietic disease during the course of alloHSCT. To this end two different next-generation-sequencing methods were compared. In a longitudinal study, bacterial swabs were taken and the microbiome analyzed from the lateral tongues of two patients and their corresponding healthy donors. The data were subsequently integrated with clinical metadata of the patients. The identified genera in the donor´s microbiome showed a similar physiological composition as previously described for healthy probands. The results from this laboratory survey of the two stem cell transplanted patients sustain previous studies that have shown a regeneration of a decreased microbiome previously treated with chemotherapy and conditioning regimen. Compared to the initial starting point prior to alloHSCT the two patients’ low number of proven genera have been detected first raising to a maximum of the taxonomic order at day 90 respectively day 120 post alloHSCT. In a direct comparison of the two sequencing methods the occurrence and total number of certain genera in the same samples differed. By using larger patient cohorts in current studies a validation of these data might be achieved. For this purpose bio-informatory diversity and cluster analyses will be applied. Possible conclusions may be drawn from differential analyses regarding patterns and kinetic of the lateral tongue oral microbiome under alloHSCT for typical complications such as sepsis, graft versus host disease, mucositis or graft rejection. With this the microbial composition would have a major impact as prognostic and diagnostic marker. | |||||||
| Lizenz: |  Urheberrechtsschutz | |||||||
| Fachbereich / Einrichtung: | Medizinische Fakultät | |||||||
| Dokument erstellt am: | 02.12.2019 | |||||||
| Dateien geändert am: | 02.12.2019 | |||||||
| Promotionsantrag am: | 13.02.2019 | |||||||
| Datum der Promotion: | 26.11.2019 |
