Dokument: Analyse der Effekte unterschiedlicher Abstände und Orientierungen von bakteriellen Transkriptionsfaktoren auf die Funktion ribosomaler RNA-Promotoren

Titel:	Analyse der Effekte unterschiedlicher Abstände und Orientierungen von bakteriellen Transkriptionsfaktoren auf die Funktion ribosomaler RNA-Promotoren
URL für Lesezeichen:	https://docserv.uni-duesseldorf.de/servlets/DocumentServlet?id=3287
URN (NBN):	urn:nbn:de:hbz:061-20060110-001287-9
Kollektion:	Dissertationen
Sprache:	Deutsch
Dokumententyp:	Wissenschaftliche Abschlussarbeiten » Dissertation
Medientyp:	Text
Autor:	Lux, Bianca [Autor]
Dateien:	[Dateien anzeigen] Adobe PDF [Details] 5,63 MB in einer Datei [ZIP-Datei erzeugen] Dateien vom 09.02.2007 / geändert 09.02.2007
Beitragende:	Prof. Dr. Wagner, Rolf [Gutachter] Prof. Dr. Ernst, Joachim F. [Gutachter]
Stichwörter:	ribosomale RNA Operons, E. coli, Promotor, UAS-Region, Transkription, H-NS, LRP, RNA-Polymerase, Phasing, faktorabhängige Regulation
Dewey Dezimal-Klassifikation:	500 Naturwissenschaften und Mathematik » 570 Biowissenschaften; Biologie
Beschreibung:	E. coli besitzt sieben ribosomale RNA Operons. Bei jedem Operon folgen auf eine regulatorische UAS-Region die tandemartig angeordneten Promotoren P1 und P2, von denen die Transkription der drei rRNA-Gene in der Reihenfolge 16S, 23S und 5S gestartet wird. Die UAS-Region ist eine AT-reiche, intrinsisch gekrümmte Region upstream der P1 Promotoren der ribosomalen RNA Operons und verursacht eine starke Transkriptionsaktivierung. Den P2 Promotoren fehlen derartige upstream-Regionen. In den meisten Fällen üben die UAS-Regionen ihre Funktion nicht direkt aus, sondern stellen Bindestellen für regulatorisch wirkende Proteine dar. Die faktorabhängige Regulation der rRNA-Synthese erfolgt durch die Transkriptionsfaktoren FIS, H-NS und LRP. Es war bereits bekannt, dass FIS als Transkriptionsaktivator auf die P1 Aktivität wirkt und H-NS als Repressor. Welche Funktion LRP besitzt, sollte in der vorliegenden Arbeit untersucht werden. Es konnte gezeigt werden, dass LRP, wie H-NS, als starker Repressor auf die P1 Aktivität wirkt. Ein weiteres Ziel dieser Arbeit war, die faktorunabhängige sowie faktorabhängige Regulation der ribosomalen Promotoren P2 und P1 zu untersuchen. Dazu wurde eine intrinsisch gekrümmte upstream-Region in unterschiedlichen Abständen und somit in verschiedener angularer Orientierung stromaufwärts des P2 und P1 Promotors des rrnB Operons kloniert. Ein Vergleich der Promotoraktivität bei den P2- und P1- Phasingkonstrukten in Abwesenheit von Transkriptionsfaktoren ergab eine von der Orientierung der upstream-Region abhängige Aktivität für beide ribosomale Promotoren. In vitro Transkriptionsanalysen zeigten, dass Abstand und "Phasing" der gekrümmten upstream-Region für die H-NS-vermittelte Regulation eine untergeordnete Rolle spielen. Für den Transkriptionsfaktor LRP konnte jedoch eine Abhängigkeit von der Orientierung seiner Bindestelle für die Stärke der Promotorregulation gefunden werden. Zudem konnte eine Bindung von LRP im P1 Promotorbereich und eine Wechselwirkung von FIS mit dem P2 Promotor anhand von "footprint"-Analysen nachgewiesen werden.
Lizenz:	Urheberrechtsschutz
Fachbereich / Einrichtung:	Mathematisch- Naturwissenschaftliche Fakultät » WE Biologie
Dokument erstellt am:	10.01.2006
Dateien geändert am:	12.02.2007
Promotionsantrag am:	08.11.2005
Datum der Promotion:	08.11.2005