Dokument: Analyse von genomischen Veränderungen in Prostatakarzinomen der Tumor-Suppressorregion 10q26 und eines putativen Prostatakarzinom-Suszeptibilitätsgens HPC2/ELAC2

Titel:Analyse von genomischen Veränderungen in Prostatakarzinomen der Tumor-Suppressorregion 10q26 und eines putativen Prostatakarzinom-Suszeptibilitätsgens HPC2/ELAC2
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URN (NBN):urn:nbn:de:hbz:061-20040407-000790-5
Kollektion:Dissertationen
Sprache:Deutsch
Dokumententyp:Wissenschaftliche Abschlussarbeiten » Dissertation
Medientyp:Text
Autor: Gerasimovski, Igor [Autor]
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Dateien vom 09.02.2007 / geändert 09.02.2007
Beitragende:Prof. Dr. Rüther, Ulrich [Gutachter]
Prof. Dr. Royer-Pokora, Brigitte [Gutachter]
Stichwörter:Prostatakarzinom, Paraffinpräparat, Mikrodissektion, I-PEP, 10q26, LOH, HPC2/ELAC2, Alanin-Threonin, Serin-Leucin, Polymorphismus, DHPLC, Prostatakarzinomgenprostate cancer, paraffin embedded tissues, microdissection, I-PEP, 10q26, LOH, HPC2/ELAC2, DHPLC, prostate cancer gene
Dewey Dezimal-Klassifikation:500 Naturwissenschaften und Mathematik » 570 Biowissenschaften; Biologie
Beschreibungen:Die bearbeiteten Themen meiner Dissertation umfassten den Bereich somatische und hereditärer Mutationen des Prostatakarzinoms.
Eine Ursache für die Entwicklung somatischer Mutationen des Prostatakarzinoms könnte u.a. auch Deletionen von Tumor–Suppressorgenen (TSG) sein. Der Verlust solcher Gene kann zu unkontrollierter Proliferation und Differenzierung der Zelle führen. Das Ziel war, durch LOH (Loss of Heterozygosity)-Analysen an Paraffinpräparaten von Prostatakarzinompatienten Deletionen in der Region 10q26 einzugrenzen. Für diese Verfahren wurden Schnittpräparate aus in Paraffin eingebettetem Tumorgewebe angefertigt und die Tumorzellen mit Hilfe eines Laser Capture Microdissection (LCM)-Gerätes oder mit einem Skalpell manuell isoliert. Anschließend wurde die DNA aus den isolierten Zellen mit Proteinase K extrahiert, unspezifisch in einer I-PEP präamplifiziert, anschließend spezifisch mit polymorphen Markern amplifiziert und auf einem Polyacrylamidgel (Licor) analysiert. In der Region 10q26 konnte durch LOH-Analysen der deletierte Bereich auf 10q26 bis auf den Marker D10S1679 eingegrenzt werden. D10S1679 ist distal vom putativen TSG FGFR2 lokalisiert. Der Beweis, ob die detektierte Deletion einen Einfluss auf die Expression von FGFR2 hat, muss anhand von Expressionsanalysen verifiziert werden.
Der zweite Teil meiner Doktorarbeit befasste sich mit der Polymorphismusanalyse eines putativen Prostatakarzinomgens. Durch Kopplungsanalysen in den USA konnte eine hereditäre Prädisposition HPC2/ELAC2 auf Chromosoms 17 in der Region 17p12.1 lokalisiert werden, bei der durch Missensemutation in Exon 17 (Ala541Thr) und bei einer gleichzeitig auftretenden Punktmutation in Exon 7 (Ser217Leu), eine erhöhte Prostatakarzinominzidenz festgestellt wurde. Anhand von Stichproben der hiesigen kaukasoiden Bevölkerung (185 Patienten und 184 Kontrollpersonen) sollte untersucht werden, ob es sich bei HPC2/ELAC2 um ein Prostatakarzinom-Suszeptibilitätsgen handelte. Diese Analyse wurde mit genomischer DNA (Blut) durchgeführt. Zu den angewandten Methoden gehörten die Restriktionsanalyse, die DHPLC (Denaturing High Performance Liquid Chromatography) und die Sequenzanalyse. Die prozentuale Verteilung des auf beiden Exons mutierten HPC2/ELAC2 war bei den Prostatakarzinompatienten und den Kontrollpersonen identisch (jeweils 1,6%). Demnach konnte HPC2/ELAC2 nicht als putatives Prostatakarzinomgen in der hiesigen Region bestätigt werden.

My dissertation involves the field of somatic and hereditary mutations in prostate cancer.
Uncontrolled cell proliferation in prostate cancer is a result of somatic mutations which may take the form of deletions in tumor-suppressor genes. The aim of this study was to elucidate deletions in the region 10q26 through LOH-analysis. Paraffin embedded prostate cancer tissues were microdissected in order to isolate cancer glands. The DNA was proteinase K extracted and preamplified by I-PEP. To analyse the deleted region in 10q26, polymorphic markers were used. The deleted region was narrowed down to D10S1679, located distal to the putative tumor-suppressor gene FGFR2. The indication that this mutation may affect the expression of FGFR2 should be verified by expression analysis.
The second part of my work was a polymorphism analysis of a putative prostate cancer gene. A genome-wide scan of large, high-risk pedigrees from Utah has provided evidence for linkage to a gene on chromosome 17p12.1 named HPC2/ELAC2. Two common missense variants in exon 17 and exon 7of the gene, called Ala541Thr and Ser217Leu, are associated with the occurrence of prostate cancer. DNA blood samples from the Caucasoid population of Duesseldorf (185 patients and 184 control persons) were analysed by DHPLC-, restriction- and sequenceanalysis. The presented results show an equal dispersal of missense mutatuins in patients affected by prostate cancer and control persons (1.6% each). According to this, the Ala541Thr- and Ser217Leu-polymorphisms have no effect on the initiation and proliferation of prostate cancer in the population studied.
Lizenz:In Copyright
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Fachbereich / Einrichtung:Mathematisch- Naturwissenschaftliche Fakultät » WE Biologie
Dokument erstellt am:07.04.2004
Dateien geändert am:12.02.2007
Promotionsantrag am:03.02.2004
Datum der Promotion:03.02.2004
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